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孙晔教授团队在壳斗科植物基因组研究方面取得重要进展

核对发表:宣传单部 曾子焉 因素计量单位及资格审查人:林学与景致园林建筑基地 陆永超 公布的日子:2021-11-02浏览次数:1261

成功,学校林学与美丽风景景观系教受孙晔在信赖刊物《Molecular Ecology Resources》(生物技术学1区Top刊物,IF2020 7.090)发布了名为“The chromosome-scale g𓃲enome assembly of Castanopsis tibetana provides a powe𓆏rful comparative framework to study the evolution and adaptation of Fagaceae trees”的研究探讨文献资料。

该学习结合Nanopore测序,short reads测序和Hi-C测序取得了钩栲Castanopsis tibetana着色体层次的用心DNA组。后面組裝的DNA组长宽比为878.6 Mb,contig N50总长度为3.3 Mb。BUSCO 估评遇到详细性为93.0%。灵活运用Hi-C技术设备将98.7%的打码回文序列锚定到钩栲12条着色体上。預测形成了4093七个蛋白酶质打码DNA,并对在当中90.04%的DNA去了功能键参考文献标注。共认定出476.9Mb的按顺序打码回文序列,TE构件遮盖的DNA组比列为39.98%。对比DNඣA组学阐述遇到钩栲DNA组历程了明显的DNA家族网增长和缩水。在53个DNA中在线🦹检测到正采用的直接证据,共平滑阐述遇到这一些DNA展现出与栎属常绿植物其他的的匀称式样,这有机会是继续融入自然环境其他自然环境的的结果。钩栲都是我国亚亚热带国家国家匀称更多的名贵灌木植物之四,是亚亚热带国家常绿阔叶林的优越名贵灌木植物。钩栲高品性能DNA组图谱的分享扩大了壳斗科的DNA组资源英文,为进入探析壳斗科而林木的融入自然环境和超进化相应而林木是如何规避全球性适宜不同给出了强关键所在的的对比DNA组知识体系。

华东畜牧业上高中林学与风光园林工程实训基地孙晔专家为该论文范文的第一点我们。本探析有了部委自然是科学课投资基金和华东畜牧业上高中楼等级引进外资人才库科研管理开机启动事业费的支助。(文图/林学与景色园林绿化教育


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